
Как пишет издание Nature, завершена первая фаза проекта Микробиома Земли (The Earth Microbiome Project, EMP). Глобальной целью данного проекта является составление наиболее полной картины биоразнообразия микроорганизмов на нашей планете.
В течении семи лет было собрано и проанализировано более 27 тыс образцов из различных сред обитания, которые собирали исследователи из 43 стран на всех континентах. С базой данных можно ознакомиться на сайте earthmicrobiome.org.
Микробим – это совокупность микроорганизмов, живущих в определенной среде и представляющих собой экологическое сообщество. Микробиом есть в любом участке почвы, водоеме, кишечнике любого живтного. В нег входят , археи, простейшие, одноклеточные грибы и вирусы
Ученые хотят определить, как устроены микробные сообщества на планете и какие законы определяют их структуру и разнообразие. Для этого они проанализировали гены рибосомальных 16S РНК в 27,751 образцах со всего мира, собранных сотнями ученых, и получили более двух миллиардов «прочтений» их ДНК (DNA sequence reads). В результате было получено более 300 тысяч уникальных последовательностей 16S РНК, из которых почти 90 процентов ранее не было известно. Авторы утверждают, что новая база данных в сравнении с предыдущими возможностями идентификации микробов аналогична сравнению Facebook с бумажной телефонной книгой.
Выяснилось, что тип среды гораздо сильнее влияет на биоразнообразие микробиома чем, например, географические факторы и многие другие экологические параметры. Также выяснилось, что микробиомы «свободных» сред гораздо более разнообразны, чем микробиомы каких-либо «хозяев».
Ученые сообщают, что полученные данные о биоразнообразии организмов в разных средах позволяют теперь, проанализировав состав и количественное соотношение разных представителей микробиома, в 90 процентов случаях верно определять среду, из которой он был получен. Такой «инструмент» может быть полезен, например, в криминалистике, полагают они.
Новая база данных содержит, во-первых, все полученные результаты, а во-вторых, позволяет удобным и унифицированным способом вносить и анализировать новые данные. В дальнейшем ученые планируют продолжать сбор данных и более полномерно изучать влияние на разнообразие микробиомов разных параметров среды, в том числе, высоты над уровнем моря, pH и температуры.
Leave a Reply